Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC3Q5JS37 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLRC3Q5JS37 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLRC3Q5JS37 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC3Q5JS37 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLRC3Q5JS37 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLRC3Q5JS37 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NHLRC3Q5JS37 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLRC3Q5JS37 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLRC3Q5JS37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC3Q5JS37 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHLRC3Q5JS37 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC3Q5JS37 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms