Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NHSL2Q5HYW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL2Q5HYW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL2Q5HYW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL2Q5HYW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NHSL2Q5HYW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NHSL2Q5HYW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NHSL2Q5HYW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NHSL2Q5HYW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NHSL2Q5HYW2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NHSL2Q5HYW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL2Q5HYW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL2Q5HYW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NHSL2Q5HYW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms