Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SGO2Q562F6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGO2Q562F6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGO2Q562F6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGO2Q562F6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGO2Q562F6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGO2Q562F6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGO2Q562F6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SGO2Q562F6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SGO2Q562F6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGO2Q562F6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGO2Q562F6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGO2Q562F6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGO2Q562F6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGO2Q562F6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms