Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NREPQ16612 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NREPQ16612 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NREPQ16612 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NREPQ16612 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NREPQ16612 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NREPQ16612 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NREPQ16612 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NREPQ16612 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NREPQ16612 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NREPQ16612 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NREPQ16612 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NREPQ16612 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NREPQ16612 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NREPQ16612 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NREPQ16612 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NREPQ16612 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NREPQ16612 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NREPQ16612 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NREPQ16612 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NREPQ16612 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NREPQ16612 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NREPQ16612 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NREPQ16612 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NREPQ16612 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NREPQ16612 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NREPQ16612 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NREPQ16612 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NREPQ16612 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NREPQ16612 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NREPQ16612 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NREPQ16612 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NREPQ16612 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NREPQ16612 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NREPQ16612 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NREPQ16612 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NREPQ16612 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NREPQ16612 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NREPQ16612 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NREPQ16612 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NREPQ16612 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NREPQ16612 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NREPQ16612 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NREPQ16612 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NREPQ16612 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NREPQ16612 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NREPQ16612 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NREPQ16612 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NREPQ16612 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NREPQ16612 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NREPQ16612 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NREPQ16612 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NREPQ16612 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NREPQ16612 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NREPQ16612 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NREPQ16612 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NREPQ16612 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NREPQ16612 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NREPQ16612 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NREPQ16612 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NREPQ16612 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NREPQ16612 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NREPQ16612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NREPQ16612 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NREPQ16612 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NREPQ16612 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NREPQ16612 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NREPQ16612 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NREPQ16612 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NREPQ16612 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NREPQ16612 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NREPQ16612 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NREPQ16612 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NREPQ16612 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NREPQ16612 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NREPQ16612 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NREPQ16612 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NREPQ16612 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NREPQ16612 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NREPQ16612 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NREPQ16612 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NREPQ16612 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NREPQ16612 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NREPQ16612 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NREPQ16612 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NREPQ16612 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NREPQ16612 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NREPQ16612 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NREPQ16612 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NREPQ16612 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NREPQ16612 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NREPQ16612 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NREPQ16612 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NREPQ16612 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NREPQ16612 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms