Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDC37Q16543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDC37Q16543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDC37Q16543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CDC37Q16543 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDC37Q16543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDC37Q16543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDC37Q16543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDC37Q16543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDC37Q16543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDC37Q16543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDC37Q16543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDC37Q16543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDC37Q16543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDC37Q16543 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDC37Q16543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDC37Q16543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CDC37Q16543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
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