Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMA4Q16363 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMA4Q16363 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMA4Q16363 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMA4Q16363 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LAMA4Q16363 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LAMA4Q16363 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMA4Q16363 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMA4Q16363 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMA4Q16363 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMA4Q16363 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMA4Q16363 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMA4Q16363 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMA4Q16363 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMA4Q16363 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMA4Q16363 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMA4Q16363 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
LAMA4Q16363 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMA4Q16363 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LAMA4Q16363 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LAMA4Q16363 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LAMA4Q16363 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMA4Q16363 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMA4Q16363 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
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