Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAD1Q15797 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMAD1Q15797 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMAD1Q15797 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMAD1Q15797 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAD1Q15797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAD1Q15797 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAD1Q15797 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMAD1Q15797 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAD1Q15797 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAD1Q15797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms