Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPEGQ15772 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEGQ15772 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPEGQ15772 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEGQ15772 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEGQ15772 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEGQ15772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPEGQ15772 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPEGQ15772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPEGQ15772 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPEGQ15772 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SPEGQ15772 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPEGQ15772 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPEGQ15772 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPEGQ15772 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPEGQ15772 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPEGQ15772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPEGQ15772 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPEGQ15772 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPEGQ15772 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPEGQ15772 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPEGQ15772 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPEGQ15772 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPEGQ15772 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPEGQ15772 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms