Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NCOA2Q15596 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NCOA2Q15596 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
NCOA2Q15596 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NCOA2Q15596 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NCOA2Q15596 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
NCOA2Q15596 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCOA2Q15596 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
NCOA2Q15596 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
NCOA2Q15596 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NCOA2Q15596 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCOA2Q15596 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCOA2Q15596 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NCOA2Q15596 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NCOA2Q15596 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43■■■■■ 4.47
NCOA2Q15596 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NCOA2Q15596 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCOA2Q15596 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
NCOA2Q15596 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NCOA2Q15596 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
NCOA2Q15596 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCOA2Q15596 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA2Q15596 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA2Q15596 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCOA2Q15596 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
NCOA2Q15596 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
NCOA2Q15596 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCOA2Q15596 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NCOA2Q15596 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
NCOA2Q15596 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCOA2Q15596 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCOA2Q15596 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCOA2Q15596 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NCOA2Q15596 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCOA2Q15596 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NCOA2Q15596 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NCOA2Q15596 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
NCOA2Q15596 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
NCOA2Q15596 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
NCOA2Q15596 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NCOA2Q15596 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NCOA2Q15596 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
NCOA2Q15596 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
NCOA2Q15596 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NCOA2Q15596 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NCOA2Q15596 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms