Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDK3Q15120 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDK3Q15120 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK3Q15120 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK3Q15120 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK3Q15120 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDK3Q15120 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDK3Q15120 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDK3Q15120 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDK3Q15120 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDK3Q15120 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDK3Q15120 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDK3Q15120 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms