Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB39AQ14964 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB39AQ14964 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB39AQ14964 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB39AQ14964 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB39AQ14964 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB39AQ14964 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB39AQ14964 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB39AQ14964 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB39AQ14964 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB39AQ14964 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB39AQ14964 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB39AQ14964 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB39AQ14964 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB39AQ14964 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB39AQ14964 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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