Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CNGB1Q14028 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CNGB1Q14028 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CNGB1Q14028 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CNGB1Q14028 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CNGB1Q14028 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CNGB1Q14028 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CNGB1Q14028 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CNGB1Q14028 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CNGB1Q14028 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CNGB1Q14028 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CNGB1Q14028 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CNGB1Q14028 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CNGB1Q14028 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CNGB1Q14028 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CNGB1Q14028 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CNGB1Q14028 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CNGB1Q14028 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CNGB1Q14028 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CNGB1Q14028 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CNGB1Q14028 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CNGB1Q14028 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CNGB1Q14028 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CNGB1Q14028 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CNGB1Q14028 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CNGB1Q14028 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
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