Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX1Q13596 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX1Q13596 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX1Q13596 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX1Q13596 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX1Q13596 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SNX1Q13596 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX1Q13596 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX1Q13596 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX1Q13596 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX1Q13596 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX1Q13596 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX1Q13596 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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