Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IRF5Q13568 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IRF5Q13568 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
IRF5Q13568 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IRF5Q13568 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
IRF5Q13568 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IRF5Q13568 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IRF5Q13568 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
IRF5Q13568 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IRF5Q13568 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IRF5Q13568 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IRF5Q13568 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IRF5Q13568 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRF5Q13568 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IRF5Q13568 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
IRF5Q13568 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
IRF5Q13568 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
IRF5Q13568 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IRF5Q13568 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
IRF5Q13568 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IRF5Q13568 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IRF5Q13568 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IRF5Q13568 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
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