Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
IRF5Q13568 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
IRF5Q13568 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
IRF5Q13568 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
IRF5Q13568 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IRF5Q13568 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IRF5Q13568 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
IRF5Q13568 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IRF5Q13568 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IRF5Q13568 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IRF5Q13568 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
IRF5Q13568 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IRF5Q13568 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
IRF5Q13568 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IRF5Q13568 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IRF5Q13568 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
IRF5Q13568 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
IRF5Q13568 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
IRF5Q13568 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
IRF5Q13568 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
IRF5Q13568 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
IRF5Q13568 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
IRF5Q13568 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IRF5Q13568 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IRF5Q13568 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IRF5Q13568 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IRF5Q13568 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
IRF5Q13568 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IRF5Q13568 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IRF5Q13568 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
IRF5Q13568 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
IRF5Q13568 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
IRF5Q13568 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IRF5Q13568 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IRF5Q13568 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IRF5Q13568 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
IRF5Q13568 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
IRF5Q13568 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IRF5Q13568 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
IRF5Q13568 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRF5Q13568 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
IRF5Q13568 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IRF5Q13568 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
IRF5Q13568 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
IRF5Q13568 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRF5Q13568 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
IRF5Q13568 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IRF5Q13568 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IRF5Q13568 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IRF5Q13568 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IRF5Q13568 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IRF5Q13568 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IRF5Q13568 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IRF5Q13568 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IRF5Q13568 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IRF5Q13568 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IRF5Q13568 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IRF5Q13568 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IRF5Q13568 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IRF5Q13568 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IRF5Q13568 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IRF5Q13568 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IRF5Q13568 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
IRF5Q13568 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IRF5Q13568 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IRF5Q13568 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IRF5Q13568 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IRF5Q13568 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IRF5Q13568 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IRF5Q13568 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRF5Q13568 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
IRF5Q13568 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IRF5Q13568 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
IRF5Q13568 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
IRF5Q13568 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
IRF5Q13568 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
IRF5Q13568 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
IRF5Q13568 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
IRF5Q13568 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IRF5Q13568 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IRF5Q13568 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IRF5Q13568 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IRF5Q13568 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IRF5Q13568 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
IRF5Q13568 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRF5Q13568 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
IRF5Q13568 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IRF5Q13568 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34■■■■□ 3.03
IRF5Q13568 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IRF5Q13568 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IRF5Q13568 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IRF5Q13568 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IRF5Q13568 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRF5Q13568 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
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