Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDE3BQ13370 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDE3BQ13370 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDE3BQ13370 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PDE3BQ13370 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PDE3BQ13370 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PDE3BQ13370 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PDE3BQ13370 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PDE3BQ13370 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PDE3BQ13370 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDE3BQ13370 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDE3BQ13370 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PDE3BQ13370 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDE3BQ13370 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDE3BQ13370 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDE3BQ13370 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDE3BQ13370 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PDE3BQ13370 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDE3BQ13370 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PDE3BQ13370 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PDE3BQ13370 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PDE3BQ13370 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PDE3BQ13370 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PDE3BQ13370 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PDE3BQ13370 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDE3BQ13370 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
PDE3BQ13370 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDE3BQ13370 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PDE3BQ13370 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PDE3BQ13370 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDE3BQ13370 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PDE3BQ13370 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PDE3BQ13370 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PDE3BQ13370 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PDE3BQ13370 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
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