Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PDE3BQ13370 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDE3BQ13370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PDE3BQ13370 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PDE3BQ13370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PDE3BQ13370 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
PDE3BQ13370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PDE3BQ13370 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3BQ13370 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3BQ13370 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3BQ13370 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PDE3BQ13370 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PDE3BQ13370 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PDE3BQ13370 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDE3BQ13370 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PDE3BQ13370 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PDE3BQ13370 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PDE3BQ13370 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
PDE3BQ13370 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PDE3BQ13370 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PDE3BQ13370 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
PDE3BQ13370 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PDE3BQ13370 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PDE3BQ13370 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
PDE3BQ13370 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDE3BQ13370 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDE3BQ13370 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PDE3BQ13370 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PDE3BQ13370 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDE3BQ13370 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
PDE3BQ13370 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDE3BQ13370 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PDE3BQ13370 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDE3BQ13370 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDE3BQ13370 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
PDE3BQ13370 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDE3BQ13370 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PDE3BQ13370 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PDE3BQ13370 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PDE3BQ13370 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PDE3BQ13370 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDE3BQ13370 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PDE3BQ13370 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDE3BQ13370 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PDE3BQ13370 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PDE3BQ13370 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PDE3BQ13370 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDE3BQ13370 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDE3BQ13370 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDE3BQ13370 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDE3BQ13370 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PDE3BQ13370 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PDE3BQ13370 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PDE3BQ13370 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDE3BQ13370 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDE3BQ13370 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PDE3BQ13370 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PDE3BQ13370 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDE3BQ13370 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PDE3BQ13370 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PDE3BQ13370 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PDE3BQ13370 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PDE3BQ13370 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PDE3BQ13370 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PDE3BQ13370 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PDE3BQ13370 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PDE3BQ13370 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
PDE3BQ13370 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PDE3BQ13370 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PDE3BQ13370 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
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