Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBQ06643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBQ06643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBQ06643 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBQ06643 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBQ06643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBQ06643 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBQ06643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBQ06643 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBQ06643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBQ06643 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBQ06643 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBQ06643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBQ06643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBQ06643 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBQ06643 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBQ06643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBQ06643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBQ06643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBQ06643 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBQ06643 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBQ06643 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBQ06643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBQ06643 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBQ06643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBQ06643 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBQ06643 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBQ06643 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBQ06643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBQ06643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBQ06643 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBQ06643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBQ06643 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBQ06643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBQ06643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBQ06643 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBQ06643 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBQ06643 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBQ06643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBQ06643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBQ06643 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBQ06643 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBQ06643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBQ06643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBQ06643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBQ06643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBQ06643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBQ06643 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBQ06643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBQ06643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBQ06643 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBQ06643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LTBQ06643 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBQ06643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LTBQ06643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBQ06643 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBQ06643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBQ06643 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LTBQ06643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBQ06643 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LTBQ06643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LTBQ06643 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBQ06643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LTBQ06643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBQ06643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBQ06643 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBQ06643 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBQ06643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBQ06643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBQ06643 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBQ06643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBQ06643 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBQ06643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBQ06643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBQ06643 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBQ06643 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBQ06643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBQ06643 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBQ06643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBQ06643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBQ06643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBQ06643 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBQ06643 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBQ06643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBQ06643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBQ06643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBQ06643 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBQ06643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBQ06643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBQ06643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBQ06643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBQ06643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBQ06643 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LTBQ06643 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LTBQ06643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms