Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1Q01196 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUNX1Q01196 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX1Q01196 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1Q01196 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX1Q01196 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX1Q01196 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNX1Q01196 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms