Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARF1P84077 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF1P84077 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF1P84077 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARF1P84077 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF1P84077 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARF1P84077 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF1P84077 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARF1P84077 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF1P84077 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF1P84077 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARF1P84077 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF1P84077 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARF1P84077 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF1P84077 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF1P84077 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARF1P84077 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF1P84077 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF1P84077 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARF1P84077 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARF1P84077 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARF1P84077 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARF1P84077 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF1P84077 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF1P84077 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARF1P84077 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARF1P84077 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF1P84077 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF1P84077 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF1P84077 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF1P84077 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF1P84077 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF1P84077 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF1P84077 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF1P84077 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF1P84077 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF1P84077 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF1P84077 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF1P84077 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF1P84077 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF1P84077 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF1P84077 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF1P84077 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF1P84077 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF1P84077 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARF1P84077 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF1P84077 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF1P84077 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF1P84077 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF1P84077 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARF1P84077 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF1P84077 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF1P84077 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF1P84077 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF1P84077 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF1P84077 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF1P84077 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF1P84077 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARF1P84077 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARF1P84077 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF1P84077 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF1P84077 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF1P84077 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF1P84077 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF1P84077 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF1P84077 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF1P84077 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF1P84077 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF1P84077 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARF1P84077 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARF1P84077 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF1P84077 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARF1P84077 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF1P84077 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF1P84077 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARF1P84077 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF1P84077 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARF1P84077 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF1P84077 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF1P84077 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF1P84077 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARF1P84077 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARF1P84077 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF1P84077 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF1P84077 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARF1P84077 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARF1P84077 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARF1P84077 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARF1P84077 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF1P84077 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARF1P84077 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF1P84077 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF1P84077 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF1P84077 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF1P84077 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARF1P84077 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF1P84077 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF1P84077 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARF1P84077 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARF1P84077 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms