Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COG7P83436 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG7P83436 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG7P83436 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG7P83436 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG7P83436 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COG7P83436 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG7P83436 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COG7P83436 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COG7P83436 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
COG7P83436 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG7P83436 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COG7P83436 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COG7P83436 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COG7P83436 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COG7P83436 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG7P83436 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COG7P83436 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
COG7P83436 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COG7P83436 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG7P83436 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG7P83436 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COG7P83436 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG7P83436 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
COG7P83436 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COG7P83436 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG7P83436 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG7P83436 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG7P83436 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG7P83436 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG7P83436 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG7P83436 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG7P83436 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COG7P83436 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COG7P83436 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG7P83436 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG7P83436 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG7P83436 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG7P83436 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG7P83436 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG7P83436 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG7P83436 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG7P83436 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG7P83436 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG7P83436 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG7P83436 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG7P83436 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG7P83436 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG7P83436 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG7P83436 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG7P83436 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG7P83436 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COG7P83436 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG7P83436 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG7P83436 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG7P83436 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COG7P83436 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG7P83436 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COG7P83436 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG7P83436 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG7P83436 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG7P83436 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG7P83436 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG7P83436 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG7P83436 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG7P83436 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG7P83436 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG7P83436 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG7P83436 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG7P83436 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG7P83436 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG7P83436 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COG7P83436 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG7P83436 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG7P83436 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG7P83436 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG7P83436 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG7P83436 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG7P83436 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG7P83436 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG7P83436 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG7P83436 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG7P83436 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG7P83436 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG7P83436 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG7P83436 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG7P83436 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG7P83436 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG7P83436 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG7P83436 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG7P83436 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG7P83436 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG7P83436 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG7P83436 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG7P83436 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG7P83436 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG7P83436 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG7P83436 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG7P83436 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG7P83436 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms