Protein–RNA interactions for Protein: P78537

BLOC1S1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S1P78537 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BLOC1S1P78537 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BLOC1S1P78537 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BLOC1S1P78537 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BLOC1S1P78537 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BLOC1S1P78537 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BLOC1S1P78537 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BLOC1S1P78537 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BLOC1S1P78537 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BLOC1S1P78537 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BLOC1S1P78537 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S1P78537 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms