Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFC1-1P60608 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1-1P60608 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVFC1-1P60608 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVFC1-1P60608 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVFC1-1P60608 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVFC1-1P60608 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1-1P60608 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVFC1-1P60608 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFC1-1P60608 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms