Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTENP60484 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTENP60484 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTENP60484 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTENP60484 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTENP60484 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTENP60484 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTENP60484 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTENP60484 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTENP60484 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTENP60484 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTENP60484 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTENP60484 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTENP60484 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTENP60484 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTENP60484 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTENP60484 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTENP60484 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTENP60484 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTENP60484 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTENP60484 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTENP60484 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTENP60484 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTENP60484 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTENP60484 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTENP60484 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTENP60484 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTENP60484 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PTENP60484 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTENP60484 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTENP60484 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTENP60484 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTENP60484 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTENP60484 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTENP60484 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTENP60484 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTENP60484 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTENP60484 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTENP60484 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTENP60484 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTENP60484 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTENP60484 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTENP60484 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTENP60484 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTENP60484 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTENP60484 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTENP60484 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTENP60484 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTENP60484 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTENP60484 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTENP60484 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTENP60484 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTENP60484 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTENP60484 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTENP60484 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTENP60484 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTENP60484 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTENP60484 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTENP60484 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTENP60484 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTENP60484 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTENP60484 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTENP60484 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTENP60484 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTENP60484 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTENP60484 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTENP60484 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTENP60484 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTENP60484 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTENP60484 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTENP60484 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTENP60484 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTENP60484 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTENP60484 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTENP60484 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTENP60484 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTENP60484 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTENP60484 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTENP60484 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTENP60484 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTENP60484 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTENP60484 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTENP60484 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTENP60484 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTENP60484 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTENP60484 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTENP60484 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTENP60484 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTENP60484 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTENP60484 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTENP60484 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTENP60484 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTENP60484 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTENP60484 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTENP60484 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTENP60484 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTENP60484 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTENP60484 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTENP60484 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTENP60484 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms