Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GEMIN4P57678 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GEMIN4P57678 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GEMIN4P57678 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GEMIN4P57678 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GEMIN4P57678 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GEMIN4P57678 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GEMIN4P57678 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GEMIN4P57678 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GEMIN4P57678 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GEMIN4P57678 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GEMIN4P57678 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GEMIN4P57678 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms