Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFV3P56181 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFV3P56181 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFV3P56181 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFV3P56181 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFV3P56181 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFV3P56181 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFV3P56181 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFV3P56181 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFV3P56181 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NDUFV3P56181 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFV3P56181 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFV3P56181 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms