Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAG2P55895 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAG2P55895 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAG2P55895 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAG2P55895 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAG2P55895 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAG2P55895 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAG2P55895 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAG2P55895 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAG2P55895 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAG2P55895 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAG2P55895 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAG2P55895 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAG2P55895 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAG2P55895 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAG2P55895 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAG2P55895 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAG2P55895 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAG2P55895 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAG2P55895 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAG2P55895 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAG2P55895 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAG2P55895 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAG2P55895 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAG2P55895 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAG2P55895 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAG2P55895 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAG2P55895 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAG2P55895 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAG2P55895 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAG2P55895 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAG2P55895 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAG2P55895 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAG2P55895 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAG2P55895 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAG2P55895 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAG2P55895 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAG2P55895 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAG2P55895 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAG2P55895 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAG2P55895 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAG2P55895 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAG2P55895 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAG2P55895 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAG2P55895 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAG2P55895 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAG2P55895 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAG2P55895 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAG2P55895 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAG2P55895 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAG2P55895 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAG2P55895 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAG2P55895 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAG2P55895 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAG2P55895 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAG2P55895 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAG2P55895 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAG2P55895 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAG2P55895 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAG2P55895 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAG2P55895 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAG2P55895 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAG2P55895 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAG2P55895 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAG2P55895 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAG2P55895 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAG2P55895 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAG2P55895 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAG2P55895 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAG2P55895 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAG2P55895 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAG2P55895 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAG2P55895 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAG2P55895 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAG2P55895 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAG2P55895 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAG2P55895 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAG2P55895 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAG2P55895 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAG2P55895 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAG2P55895 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAG2P55895 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAG2P55895 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAG2P55895 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAG2P55895 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAG2P55895 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAG2P55895 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAG2P55895 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAG2P55895 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAG2P55895 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAG2P55895 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAG2P55895 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAG2P55895 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAG2P55895 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAG2P55895 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAG2P55895 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAG2P55895 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAG2P55895 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAG2P55895 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAG2P55895 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms