Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFAP4P55083 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFAP4P55083 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFAP4P55083 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFAP4P55083 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MFAP4P55083 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MFAP4P55083 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFAP4P55083 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFAP4P55083 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MFAP4P55083 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFAP4P55083 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFAP4P55083 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MFAP4P55083 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MFAP4P55083 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms