Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF2A1P52655 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF2A1P52655 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF2A1P52655 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF2A1P52655 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2A1P52655 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A1P52655 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GTF2A1P52655 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2A1P52655 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2A1P52655 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2A1P52655 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2A1P52655 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A1P52655 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2A1P52655 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A1P52655 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A1P52655 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A1P52655 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms