Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A2P50993 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP1A2P50993 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP1A2P50993 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A2P50993 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP1A2P50993 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP1A2P50993 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP1A2P50993 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP1A2P50993 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP1A2P50993 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A2P50993 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP1A2P50993 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP1A2P50993 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP1A2P50993 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP1A2P50993 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms