Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFCP49767 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VEGFCP49767 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VEGFCP49767 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VEGFCP49767 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFCP49767 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VEGFCP49767 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFCP49767 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFCP49767 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VEGFCP49767 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VEGFCP49767 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFCP49767 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFCP49767 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFCP49767 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VEGFCP49767 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VEGFCP49767 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFCP49767 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms