Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUMBP49757 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUMBP49757 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUMBP49757 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUMBP49757 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUMBP49757 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUMBP49757 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUMBP49757 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUMBP49757 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUMBP49757 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUMBP49757 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUMBP49757 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUMBP49757 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUMBP49757 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NUMBP49757 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NUMBP49757 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUMBP49757 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUMBP49757 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUMBP49757 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NUMBP49757 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUMBP49757 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NUMBP49757 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NUMBP49757 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NUMBP49757 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NUMBP49757 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NUMBP49757 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUMBP49757 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUMBP49757 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUMBP49757 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUMBP49757 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUMBP49757 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUMBP49757 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUMBP49757 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUMBP49757 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUMBP49757 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUMBP49757 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUMBP49757 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUMBP49757 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUMBP49757 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NUMBP49757 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUMBP49757 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUMBP49757 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUMBP49757 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUMBP49757 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUMBP49757 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUMBP49757 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUMBP49757 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUMBP49757 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUMBP49757 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUMBP49757 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUMBP49757 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUMBP49757 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUMBP49757 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUMBP49757 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUMBP49757 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUMBP49757 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUMBP49757 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUMBP49757 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUMBP49757 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBP49757 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBP49757 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUMBP49757 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBP49757 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBP49757 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUMBP49757 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUMBP49757 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUMBP49757 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUMBP49757 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUMBP49757 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUMBP49757 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUMBP49757 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUMBP49757 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBP49757 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBP49757 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBP49757 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBP49757 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBP49757 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUMBP49757 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUMBP49757 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUMBP49757 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUMBP49757 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUMBP49757 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUMBP49757 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUMBP49757 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUMBP49757 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUMBP49757 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUMBP49757 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUMBP49757 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUMBP49757 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUMBP49757 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUMBP49757 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUMBP49757 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBP49757 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBP49757 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBP49757 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUMBP49757 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUMBP49757 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUMBP49757 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUMBP49757 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUMBP49757 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms