Protein–RNA interactions for Protein: P49747

COMP, Cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMPP49747 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMPP49747 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMPP49747 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMPP49747 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMPP49747 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMPP49747 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMPP49747 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMPP49747 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMPP49747 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COMPP49747 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COMPP49747 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMPP49747 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMPP49747 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMPP49747 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMPP49747 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMPP49747 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMPP49747 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMPP49747 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMPP49747 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMPP49747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMPP49747 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMPP49747 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMPP49747 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMPP49747 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMPP49747 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMPP49747 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMPP49747 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMPP49747 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMPP49747 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COMPP49747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMPP49747 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMPP49747 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COMPP49747 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMPP49747 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMPP49747 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMPP49747 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMPP49747 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMPP49747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMPP49747 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMPP49747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMPP49747 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMPP49747 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COMPP49747 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMPP49747 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMPP49747 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMPP49747 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMPP49747 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMPP49747 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMPP49747 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMPP49747 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMPP49747 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMPP49747 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMPP49747 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMPP49747 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMPP49747 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMPP49747 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMPP49747 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMPP49747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMPP49747 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMPP49747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMPP49747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMPP49747 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMPP49747 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COMPP49747 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COMPP49747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COMPP49747 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMPP49747 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COMPP49747 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COMPP49747 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMPP49747 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COMPP49747 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COMPP49747 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COMPP49747 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMPP49747 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COMPP49747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COMPP49747 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COMPP49747 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COMPP49747 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMPP49747 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMPP49747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COMPP49747 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMPP49747 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMPP49747 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMPP49747 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMPP49747 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMPP49747 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COMPP49747 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMPP49747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMPP49747 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMPP49747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMPP49747 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMPP49747 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMPP49747 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMPP49747 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMPP49747 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms