Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB2P49721 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB2P49721 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB2P49721 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB2P49721 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB2P49721 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB2P49721 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB2P49721 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PSMB2P49721 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMB2P49721 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1409.1 ms