Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMB2P49721 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB2P49721 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB2P49721 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMB2P49721 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB2P49721 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB2P49721 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB2P49721 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB2P49721 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB2P49721 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB2P49721 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB2P49721 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB2P49721 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB2P49721 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB2P49721 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB2P49721 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB2P49721 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB2P49721 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB2P49721 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB2P49721 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB2P49721 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB2P49721 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB2P49721 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB2P49721 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB2P49721 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB2P49721 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB2P49721 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB2P49721 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB2P49721 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB2P49721 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB2P49721 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB2P49721 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB2P49721 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB2P49721 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB2P49721 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB2P49721 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB2P49721 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB2P49721 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB2P49721 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB2P49721 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB2P49721 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB2P49721 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB2P49721 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB2P49721 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB2P49721 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB2P49721 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB2P49721 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB2P49721 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB2P49721 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB2P49721 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB2P49721 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB2P49721 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB2P49721 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB2P49721 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB2P49721 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB2P49721 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB2P49721 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB2P49721 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB2P49721 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB2P49721 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB2P49721 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB2P49721 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB2P49721 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB2P49721 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB2P49721 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB2P49721 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB2P49721 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB2P49721 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB2P49721 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB2P49721 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB2P49721 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB2P49721 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB2P49721 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB2P49721 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB2P49721 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB2P49721 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB2P49721 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB2P49721 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB2P49721 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB2P49721 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms