Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSFMP43897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSFMP43897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSFMP43897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSFMP43897 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSFMP43897 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSFMP43897 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSFMP43897 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSFMP43897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSFMP43897 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSFMP43897 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSFMP43897 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSFMP43897 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSFMP43897 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TSFMP43897 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSFMP43897 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSFMP43897 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSFMP43897 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSFMP43897 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSFMP43897 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSFMP43897 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSFMP43897 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSFMP43897 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSFMP43897 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSFMP43897 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSFMP43897 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSFMP43897 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSFMP43897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSFMP43897 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSFMP43897 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSFMP43897 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSFMP43897 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSFMP43897 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSFMP43897 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSFMP43897 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSFMP43897 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSFMP43897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSFMP43897 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSFMP43897 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSFMP43897 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSFMP43897 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSFMP43897 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSFMP43897 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSFMP43897 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSFMP43897 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSFMP43897 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSFMP43897 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSFMP43897 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSFMP43897 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TSFMP43897 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSFMP43897 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSFMP43897 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSFMP43897 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TSFMP43897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSFMP43897 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSFMP43897 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSFMP43897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSFMP43897 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSFMP43897 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSFMP43897 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSFMP43897 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSFMP43897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSFMP43897 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSFMP43897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSFMP43897 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSFMP43897 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSFMP43897 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSFMP43897 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TSFMP43897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSFMP43897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSFMP43897 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSFMP43897 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSFMP43897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSFMP43897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSFMP43897 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSFMP43897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSFMP43897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSFMP43897 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSFMP43897 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSFMP43897 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSFMP43897 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSFMP43897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSFMP43897 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSFMP43897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSFMP43897 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSFMP43897 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TSFMP43897 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSFMP43897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSFMP43897 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSFMP43897 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSFMP43897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSFMP43897 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSFMP43897 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSFMP43897 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSFMP43897 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms