Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA4P43694 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATA4P43694 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA4P43694 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA4P43694 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA4P43694 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATA4P43694 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA4P43694 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA4P43694 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA4P43694 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GATA4P43694 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA4P43694 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA4P43694 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATA4P43694 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA4P43694 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA4P43694 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA4P43694 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA4P43694 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA4P43694 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA4P43694 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA4P43694 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATA4P43694 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA4P43694 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA4P43694 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA4P43694 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA4P43694 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA4P43694 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA4P43694 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA4P43694 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA4P43694 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA4P43694 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA4P43694 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATA4P43694 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA4P43694 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA4P43694 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA4P43694 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA4P43694 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA4P43694 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA4P43694 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATA4P43694 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA4P43694 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GATA4P43694 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA4P43694 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA4P43694 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATA4P43694 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA4P43694 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA4P43694 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA4P43694 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATA4P43694 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA4P43694 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA4P43694 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA4P43694 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA4P43694 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA4P43694 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA4P43694 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA4P43694 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA4P43694 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATA4P43694 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA4P43694 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA4P43694 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA4P43694 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA4P43694 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA4P43694 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATA4P43694 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA4P43694 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA4P43694 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA4P43694 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATA4P43694 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA4P43694 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA4P43694 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA4P43694 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA4P43694 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA4P43694 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA4P43694 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA4P43694 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA4P43694 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA4P43694 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA4P43694 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA4P43694 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA4P43694 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA4P43694 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA4P43694 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA4P43694 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA4P43694 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA4P43694 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA4P43694 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA4P43694 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA4P43694 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA4P43694 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA4P43694 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA4P43694 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA4P43694 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA4P43694 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA4P43694 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA4P43694 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATA4P43694 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA4P43694 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA4P43694 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA4P43694 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA4P43694 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms