Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRP43088 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRP43088 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRP43088 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGFRP43088 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRP43088 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGFRP43088 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGFRP43088 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGFRP43088 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGFRP43088 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGFRP43088 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms