Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PFN2P35080 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PFN2P35080 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PFN2P35080 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PFN2P35080 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PFN2P35080 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PFN2P35080 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PFN2P35080 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PFN2P35080 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PFN2P35080 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PFN2P35080 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PFN2P35080 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PFN2P35080 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PFN2P35080 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFN2P35080 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFN2P35080 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PFN2P35080 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFN2P35080 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFN2P35080 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFN2P35080 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PFN2P35080 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PFN2P35080 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PFN2P35080 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PFN2P35080 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PFN2P35080 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFN2P35080 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFN2P35080 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFN2P35080 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFN2P35080 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFN2P35080 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFN2P35080 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFN2P35080 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PFN2P35080 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFN2P35080 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PFN2P35080 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFN2P35080 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFN2P35080 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFN2P35080 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PFN2P35080 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFN2P35080 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFN2P35080 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFN2P35080 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PFN2P35080 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFN2P35080 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFN2P35080 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFN2P35080 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFN2P35080 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PFN2P35080 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PFN2P35080 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PFN2P35080 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PFN2P35080 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PFN2P35080 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PFN2P35080 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PFN2P35080 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PFN2P35080 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PFN2P35080 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PFN2P35080 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PFN2P35080 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PFN2P35080 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PFN2P35080 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PFN2P35080 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PFN2P35080 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PFN2P35080 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PFN2P35080 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PFN2P35080 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PFN2P35080 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PFN2P35080 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PFN2P35080 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PFN2P35080 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PFN2P35080 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PFN2P35080 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFN2P35080 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFN2P35080 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFN2P35080 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFN2P35080 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFN2P35080 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFN2P35080 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFN2P35080 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFN2P35080 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFN2P35080 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFN2P35080 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFN2P35080 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFN2P35080 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFN2P35080 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFN2P35080 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFN2P35080 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFN2P35080 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFN2P35080 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFN2P35080 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFN2P35080 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFN2P35080 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFN2P35080 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFN2P35080 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFN2P35080 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFN2P35080 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFN2P35080 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PFN2P35080 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFN2P35080 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFN2P35080 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFN2P35080 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms