Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGER1P34995 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER1P34995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGER1P34995 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGER1P34995 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTGER1P34995 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGER1P34995 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER1P34995 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER1P34995 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTGER1P34995 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER1P34995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms