Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALDH4A1P30038 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH4A1P30038 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH4A1P30038 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH4A1P30038 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH4A1P30038 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH4A1P30038 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH4A1P30038 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH4A1P30038 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALDH4A1P30038 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH4A1P30038 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH4A1P30038 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH4A1P30038 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALDH4A1P30038 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms