Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRNP28799 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRNP28799 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRNP28799 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GRNP28799 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRNP28799 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRNP28799 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRNP28799 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRNP28799 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRNP28799 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRNP28799 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRNP28799 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRNP28799 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRNP28799 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRNP28799 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRNP28799 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRNP28799 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRNP28799 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRNP28799 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRNP28799 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRNP28799 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRNP28799 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRNP28799 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRNP28799 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRNP28799 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRNP28799 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRNP28799 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRNP28799 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRNP28799 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRNP28799 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRNP28799 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRNP28799 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRNP28799 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRNP28799 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRNP28799 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRNP28799 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRNP28799 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRNP28799 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRNP28799 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRNP28799 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRNP28799 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRNP28799 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRNP28799 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRNP28799 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRNP28799 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRNP28799 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRNP28799 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRNP28799 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRNP28799 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRNP28799 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRNP28799 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRNP28799 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRNP28799 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRNP28799 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRNP28799 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRNP28799 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRNP28799 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRNP28799 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRNP28799 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRNP28799 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRNP28799 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRNP28799 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRNP28799 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRNP28799 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRNP28799 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRNP28799 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRNP28799 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRNP28799 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRNP28799 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRNP28799 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRNP28799 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRNP28799 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRNP28799 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRNP28799 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRNP28799 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRNP28799 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRNP28799 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRNP28799 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRNP28799 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRNP28799 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRNP28799 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRNP28799 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRNP28799 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRNP28799 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRNP28799 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRNP28799 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRNP28799 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRNP28799 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRNP28799 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms