Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PSMA5P28066 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PSMA5P28066 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSMA5P28066 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSMA5P28066 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSMA5P28066 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSMA5P28066 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PSMA5P28066 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSMA5P28066 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSMA5P28066 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PSMA5P28066 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSMA5P28066 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PSMA5P28066 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PSMA5P28066 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PSMA5P28066 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PSMA5P28066 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSMA5P28066 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSMA5P28066 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms