Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAX6P26367 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX6P26367 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAX6P26367 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX6P26367 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX6P26367 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAX6P26367 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAX6P26367 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX6P26367 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAX6P26367 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX6P26367 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX6P26367 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAX6P26367 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX6P26367 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAX6P26367 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAX6P26367 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX6P26367 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAX6P26367 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX6P26367 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAX6P26367 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX6P26367 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAX6P26367 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX6P26367 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX6P26367 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAX6P26367 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAX6P26367 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAX6P26367 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAX6P26367 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX6P26367 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAX6P26367 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX6P26367 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX6P26367 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX6P26367 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAX6P26367 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX6P26367 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX6P26367 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAX6P26367 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX6P26367 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX6P26367 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAX6P26367 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAX6P26367 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX6P26367 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAX6P26367 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX6P26367 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX6P26367 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX6P26367 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAX6P26367 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX6P26367 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAX6P26367 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAX6P26367 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX6P26367 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAX6P26367 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX6P26367 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX6P26367 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAX6P26367 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAX6P26367 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAX6P26367 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX6P26367 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAX6P26367 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX6P26367 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX6P26367 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX6P26367 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAX6P26367 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX6P26367 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PAX6P26367 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAX6P26367 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAX6P26367 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX6P26367 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX6P26367 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAX6P26367 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX6P26367 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAX6P26367 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX6P26367 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX6P26367 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX6P26367 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAX6P26367 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX6P26367 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX6P26367 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAX6P26367 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX6P26367 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX6P26367 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAX6P26367 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX6P26367 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAX6P26367 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX6P26367 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX6P26367 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX6P26367 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAX6P26367 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAX6P26367 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAX6P26367 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAX6P26367 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAX6P26367 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAX6P26367 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAX6P26367 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX6P26367 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX6P26367 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAX6P26367 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX6P26367 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX6P26367 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAX6P26367 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms