Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMA1P25391 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA1P25391 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA1P25391 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA1P25391 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA1P25391 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA1P25391 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA1P25391 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMA1P25391 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMA1P25391 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA1P25391 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMA1P25391 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMA1P25391 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA1P25391 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMA1P25391 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA1P25391 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA1P25391 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA1P25391 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA1P25391 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA1P25391 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA1P25391 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA1P25391 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMA1P25391 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA1P25391 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA1P25391 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA1P25391 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA1P25391 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA1P25391 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA1P25391 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA1P25391 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA1P25391 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA1P25391 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA1P25391 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA1P25391 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMA1P25391 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA1P25391 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA1P25391 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA1P25391 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA1P25391 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms