Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMA1P25391 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMA1P25391 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LAMA1P25391 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMA1P25391 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMA1P25391 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMA1P25391 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMA1P25391 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LAMA1P25391 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LAMA1P25391 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LAMA1P25391 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMA1P25391 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMA1P25391 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LAMA1P25391 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LAMA1P25391 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
LAMA1P25391 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LAMA1P25391 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LAMA1P25391 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LAMA1P25391 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LAMA1P25391 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LAMA1P25391 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LAMA1P25391 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LAMA1P25391 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LAMA1P25391 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LAMA1P25391 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LAMA1P25391 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LAMA1P25391 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LAMA1P25391 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LAMA1P25391 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LAMA1P25391 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LAMA1P25391 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMA1P25391 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA1P25391 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMA1P25391 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMA1P25391 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMA1P25391 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMA1P25391 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMA1P25391 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMA1P25391 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LAMA1P25391 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMA1P25391 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LAMA1P25391 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA1P25391 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LAMA1P25391 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAMA1P25391 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA1P25391 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA1P25391 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA1P25391 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA1P25391 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA1P25391 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LAMA1P25391 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LAMA1P25391 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LAMA1P25391 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMA1P25391 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMA1P25391 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LAMA1P25391 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LAMA1P25391 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LAMA1P25391 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LAMA1P25391 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LAMA1P25391 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA1P25391 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LAMA1P25391 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAMA1P25391 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAMA1P25391 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMA1P25391 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMA1P25391 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMA1P25391 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMA1P25391 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA1P25391 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMA1P25391 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMA1P25391 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA1P25391 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA1P25391 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA1P25391 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMA1P25391 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA1P25391 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA1P25391 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA1P25391 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA1P25391 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA1P25391 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA1P25391 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA1P25391 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA1P25391 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMA1P25391 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA1P25391 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA1P25391 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA1P25391 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA1P25391 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA1P25391 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA1P25391 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms