Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNCP24821 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNCP24821 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNCP24821 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNCP24821 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNCP24821 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNCP24821 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNCP24821 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNCP24821 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNCP24821 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNCP24821 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNCP24821 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNCP24821 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNCP24821 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNCP24821 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNCP24821 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNCP24821 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNCP24821 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNCP24821 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNCP24821 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNCP24821 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNCP24821 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNCP24821 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNCP24821 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNCP24821 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNCP24821 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNCP24821 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNCP24821 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNCP24821 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNCP24821 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNCP24821 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNCP24821 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNCP24821 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNCP24821 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNCP24821 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNCP24821 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNCP24821 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNCP24821 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNCP24821 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNCP24821 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNCP24821 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNCP24821 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNCP24821 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNCP24821 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNCP24821 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNCP24821 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNCP24821 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNCP24821 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNCP24821 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNCP24821 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNCP24821 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNCP24821 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNCP24821 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNCP24821 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNCP24821 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNCP24821 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNCP24821 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNCP24821 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNCP24821 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNCP24821 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNCP24821 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNCP24821 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNCP24821 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNCP24821 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNCP24821 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNCP24821 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNCP24821 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNCP24821 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNCP24821 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNCP24821 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNCP24821 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNCP24821 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TNCP24821 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNCP24821 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNCP24821 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNCP24821 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNCP24821 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNCP24821 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNCP24821 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNCP24821 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNCP24821 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNCP24821 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNCP24821 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNCP24821 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNCP24821 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNCP24821 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNCP24821 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNCP24821 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNCP24821 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNCP24821 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNCP24821 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNCP24821 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNCP24821 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNCP24821 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNCP24821 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNCP24821 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNCP24821 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNCP24821 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNCP24821 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNCP24821 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms