Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RASA1P20936 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RASA1P20936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RASA1P20936 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RASA1P20936 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RASA1P20936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RASA1P20936 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASA1P20936 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASA1P20936 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASA1P20936 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASA1P20936 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RASA1P20936 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RASA1P20936 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RASA1P20936 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RASA1P20936 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASA1P20936 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RASA1P20936 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RASA1P20936 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RASA1P20936 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RASA1P20936 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASA1P20936 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASA1P20936 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RASA1P20936 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RASA1P20936 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RASA1P20936 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RASA1P20936 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASA1P20936 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RASA1P20936 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RASA1P20936 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RASA1P20936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RASA1P20936 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RASA1P20936 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASA1P20936 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASA1P20936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASA1P20936 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RASA1P20936 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASA1P20936 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASA1P20936 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASA1P20936 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASA1P20936 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RASA1P20936 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RASA1P20936 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RASA1P20936 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RASA1P20936 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASA1P20936 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
RASA1P20936 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASA1P20936 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASA1P20936 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RASA1P20936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RASA1P20936 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RASA1P20936 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RASA1P20936 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASA1P20936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASA1P20936 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RASA1P20936 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RASA1P20936 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RASA1P20936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASA1P20936 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASA1P20936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RASA1P20936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASA1P20936 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASA1P20936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASA1P20936 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASA1P20936 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASA1P20936 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RASA1P20936 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASA1P20936 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASA1P20936 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASA1P20936 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASA1P20936 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RASA1P20936 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RASA1P20936 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RASA1P20936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RASA1P20936 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RASA1P20936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RASA1P20936 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RASA1P20936 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RASA1P20936 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RASA1P20936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RASA1P20936 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RASA1P20936 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RASA1P20936 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RASA1P20936 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RASA1P20936 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
RASA1P20936 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RASA1P20936 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RASA1P20936 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RASA1P20936 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RASA1P20936 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RASA1P20936 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RASA1P20936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RASA1P20936 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RASA1P20936 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RASA1P20936 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RASA1P20936 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RASA1P20936 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RASA1P20936 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASA1P20936 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASA1P20936 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASA1P20936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms