Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMB1P20618 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMB1P20618 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMB1P20618 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMB1P20618 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMB1P20618 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMB1P20618 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMB1P20618 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMB1P20618 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMB1P20618 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB1P20618 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms