Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB1P14653 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB1P14653 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB1P14653 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB1P14653 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB1P14653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB1P14653 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB1P14653 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXB1P14653 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB1P14653 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms